Andrzej Sypytkowski urodził się w Korszach na Warmii i Mazurach, ale od lat mieszka w Końskich. W latach 80. i 90. należał do czołowych polskich kolarzy szosowych. Największym sukcesem sportowym było zdobycie srebrnego medalu podczas Igrzysk Olimpijskich w Seulu w wyścigu drużynowym na 100 km (razem z Joachimem Halupczokiem, Zenonem Jaskułą i Markiem Leśniewskim). Rok później został wicemistrzem świata w tej samej konkurencji i w tym samym składzie. Startował także na Igrzyskach Olimpijskich w Barcelonie (1992), gdzie zarówno w wyścigu indywidualnym, jak i drużynowym zajął 6. miejsce.
Bogatą karierę sportową Andrzej Sypytkowski zakończył w 1999 roku.
Po zakończeniu kariery sportowej Andrzej Sypytkowski był m.in. dyrektorem występującej pod różnymi nazwami grupy kolarskiej CCC Polsat Polkowice. Prowadził ją m.in. w historycznym występie w Giro d’Italia. Pełni funkcję dyrektora wyścigu Szlakiem Walk Majora Hubala, którego jest pomysłodawcą i organizatorem.